Mint már az árnyvadászoknál is említettem, a rúnák, avagy jelek fontos szerepet töltenek be. A jelek nélkül sokkal nehezebben menne minden, mivel nagyon sok dologban segítenek, köztük pl. a gyógyításban is. Ugyanakkor ezek a jelek kicsit se mondhatóak veszélytelennek. Számos fajtájuk létezik, gyengéktől az erősekig, amiket lehet, hogy a sima árnyvadászok se lennének képesek testükön viselni. Az összes létező rúna megtalálható a Szürke könyvben, amire nagyon vigyáznak. Ezeket a jeleket kizárólag árnyvadászok viselhetik, mivel más lényt felemészt az erejük. Emberek esetében halálos jobbik esetben, rosszabbikban az emberek elhagyatottaká válnak tőle, ami semmi jóval nem jár, hiszen az elhagyatottak, már egyáltalán nem uruk önmaguknak, így meg kell őket ölni. A fegyvereknél is említett irónnal képesek magukra rajzolni ezeket. A legerősebb rúnákat a Néma testvérek viselik, akikről későbbiekben olvashatsz. A rúnáknak különböző hatás idejük van, előfordul, hogy valamelyik egy életre megmarad és akad olyan is, amit minden egyes használata után újra kell rajzolni. A rúnák helyei nem tűnnek el nyomtalanul, marad utánuk halványan látszó fehér heg. Némely rúnák fájnak, mikor felrajzolják őket, de idővel minden árnyvadász megszokja, így elviselhetőbbé válik. A rúnák hathatósága attól is függ, hogy ki rajzolja fel azokat(Parabatai által erősebb) és hogy milyen közel a szívhez. A legtöbb rúnát tetszés szerint lehet rajzolni a testükön bárhová, de pl. a látó rúna kézre kerülhet, míg a házzasság kötő rúnák egyike a karra, a másik pedig a szív fölé. Az árnyvadászok első rúnáikat 12 éves koruk körül kapják meg.

Fontosabb rúnák:

• Látás/látó: Ez az első jel, ami felkerül egy árnyvadászra. Ennek segítségével tisztán át tud látni az álcán, nem mellesleg örökké tartó rúna.
• Parabatai: Két harcos jóbarát közti kötő rúnának lehetne nevezni. Ezt a rúnát egymásra rajzolják fel és örökké tart. A két fél érzi, hogy ha valamelyiküknek baja esett.
• Házasság: Egymásra rajzolják szintén a párok, ez is örökre szól.
• Iratze: Fő gyógyító rúnája az árnyvadászoknak.

Egyéb rúnák:

• Pragma, Ludus, Banquet, Agape, Storge, Philia: Ezek mind a szeretet rúnákhoz tartoznak, különböző jelentéssel. Ezek közül a legelterjettebb az Agape, leginkább ezt látni sokszor.
• Rettenthetetlen, Lepusztulás, Összefogás: Ezek mind Clary által alkotott rúnák, amik nem vesznek részt egyáltalán a szerepen.